Situs Pontada berada sekitar 150 meter dari kawasan wisata Pantai Ide. Menurut cerita rakyat di Kawasan Danau Matano, situs ini merupakan kampung tua yang tenggelam dikarenakan adanya gempa bumi dan thunami. Hasil observasi geologi juga menunjukan adanya aktivitas tektonik yang menybabkan amblesan (subsidence) di wilayah sekitar situs ini. Topografi situs ini berupa kombinasi antara slope yang berada diantara dua gundukan disisi barat dan timurnya, serta area dataran disisi utaranya. Kondisi tinggalan-tinggalan arkeologi di Situs Pontada sebagian besar telah tertutup oleh lumut dan pasir halus.
Virtual Tour Situs Pontada dapat dilihat disini.